مسجد زیبا و تاریخی جامع سفلای گوگان در ضلع غربی میدان مرکزی شهر و بازار سنتی گوگان قرار گرفته است. این اثر از جمله بناهای تاریخی- مذهبی استان آذربایجانشرقی است که به سبک مساجد ستوندار عصر صفوی ساخته شده و در اوایل عصر قاجاریه نقاشی تزئین گردیده و برابر نوشتههای موجود در روی توفالهای سقف چوبی شبستان مسجد، این اثر تاریخی- مذهبی در زمان سلطنت فتحعلی شاه قاجار تعمیر شده است.
جرزهای این مسجد ۱/۵ متر ضخامت دارند و بر روی سکویی سنگی به ارتفاع حدود یک متر احداث شده و نمای بیرونی مسجد در سالهای اخیر بازسازی شده و با آجرهای جدید سه سانتیمتری نماسازی شده است. ناگفته نماند اصول مرمت و انتخاب مصالح ویژهی بناهای تاریخی در این بازسازی بطور کامل رعایت نشده است.
ورودی مسجد اینک از ضلع شرقی و از محل درگاهی جدید است و در آن چند پله جدید سنگی کار گذاشتهاند. این مسجد دارای یک حیاط در ضلع شمالی بوده ولیکن در بازسازی و گسترشهای بعمل آمده در سالهای اخیر، این حیاط و ورودی اصلی مسجد جای خود را به طرح توسعهی شبستان ستوندار مسجد ولی به شیوه و اجرای جدید و ناهمگون داده است. بهتر این بود که اهالی، مسجد جدید را بنابر نیازمندیهای امروزین خود در جای دیگری احداث میکردند و این اثر تاریخی را بدون دخل و تصرف و به شکل اولیهی خود برای اعتلای اعتبار و شهرت تاریخی شهر خویش با اصول صحیح و کارشناسی، مرمت و نگهداری مینمودند. شبستان مسجد دارای ۲۰ عدد ستون چوبی در چهار ردیف پنج تایی و نیز دارای دو فقره بالکن زنانه در قسمت فوقانی دو ضلع شرقی و غربی مسجد است.
از تنها قسمت دست نخورده و اصیل مسجد میتوان به ستونها و سرستونهای ساده و سقف مسطح چوبی تزئینی آن اشاره کرد. این بخش نفیس دارای تزئینات نقاشی و خوشنویسی متنوع روی چوب است و در واقع همانند اوراق کتابهای خطی و تابلوهای نقاشی مینیاتوری حایز اهمیت هنری ویژه است. شبستان مسجد در سال ۱۳۶۴ مورد تعمیر قرار گرفته و در مراحل مرمت آن، محراب، پنجرههای مشبک گرهچینی چوبی معروف به ارسی دو سوی محراب و قسمتی از سازههای چوبی سقف مسطح شبستان و تزئینات روی چوب آنها از بین رفته و تختههای طرحدار و منقوش نمای داخلی ازارههای شبستان نیز برداشته شده و بجای آنها از تختههای معمولی استفاده شده است.
امیر چهرهگشا